Museum Østjylland måtte i 2012 notere en mindre tilbagegang i besøgstallet. I sit første leveår, 2011, oplevede museet en publikumstilstrømning, der overgik alle forventninger med over 150.000 gæster. Men i 12 nåede det samlede besøgstal 142.682. Selv om det er en tilbagegang er Museum Østjylland fortsat blandt de bedst besøgte lokalmuseer i landet. Museet havde flest gæster i Ebeltoft med knap 71.000, Randers havde godt 50.000 besøgende og i Grenaa kiggede 21.666 inden for i museets udstillinger. Størst udvikling var der i besøgstallet i Grenaa med en fremgang på 30 % i forhold til året før.